Fischer belajar di
pada tahun
1872
dan mendapatkan gelar doktor pada tahun
1874
. Ia berkonsentrasi di bidang
kimia organik
, khususnya tentang senyawa aktif pada
kopi
,
kelapa
,
teh
, yakni
kafeina
dan
teobromin
. Ia mendirikan susunan rangkaian senyawa di bidang ini, akhirnya disintesis.
Namun, karyanya yang paling terkenal adalah pada
purin
dan
gula
. Antara tahun
1882
-
1906
ia menunjukkan melalui penelitiannya bahwa sejumlah senyawa kimia, yang belum dikenal saat itu, seperti
adenin
,
xantin
,
kafeina
,
asam urat
dan
guanin
semuanya milik keluarga yang homogen, dan bisa diturunkan dari situ. Senyawa induk tersebut, yang awalnya dianggap hipotetik, disebutnya purin pada tahun
1884
, dan disintesis pada tahun
1898
.