Stasiun Batavia merujuk pada stasiun kereta api aktif maupun nonaktif, serta merujuk pada halte trem nonaktif yang terletak di DKI Jakarta . Beberapa stasiun maupun halte yang menggunakan nama Batavia antara lain sebagaimana berikut:
Stasiun aktif
- Stasiun Batavia-Benedenstad , merupakan nama lama dari Stasiun Jakarta Kota . Dibangun oleh perusahaan Staatsspoorwegen
- Stasiun Batavia-Koningsplein , merupakan nama lama dari Stasiun Gambir . Dibangun oleh perusahaan Nederlandsch-Indische Spoorweg Maatschappij
Stasiun dan halte nonaktif
- Stasiun Batavia (NIS) , merupakan stasiun kereta api nonaktif yang dibangun oleh perusahaan Nederlandsch-Indische Spoorweg Maatschappij. Stasiun ini disebut sebagai Stasiun Batavia Noord
- Stasiun Batavia (BOS) , merupakan stasiun kereta api nonaktif yang dibangun oleh perusahaan Bataviasche Oosterspoorweg Maatschappij . Stasiun ini disebut sebagai Stasiun Batavia Zuid
- , merupakan halte trem nonaktif yang dibangun oleh perusahaan Nederlands-Indische Tramweg Maatschappij