| Rhizobium | |
|---|---|
|
|
| Rhizobium tropici on an . | |
| Klasifikasi ilmiah | |
| Kerajaan: | |
| Filum: | |
| Kelas: |
|
| Ordo: |
|
| Famili: |
|
| Genus: |
Rhizobium
Frank 1889
|
| Spesies tipe | |
|
Rhizobium leguminosarum
|
|
| Spesies [ 1 ] | |
Rhizobium adalah genus bakteri tanah Gram-negatif yang memfiksasi nitrogen . Spesies Rhizobium membentuk asosiasi pengikat nitrogen endosimbiotik dengan akar kacang-kacangan dan .
Bakteri ini mengkolonisasi sel-sel tumbuhan di dalam nodul akar , di mana mereka mengubah nitrogen atmosfer menjadi amonia dan kemudian memberikan senyawa nitrogen organik seperti glutamina atau ke tanaman. Tanaman, pada gilirannya, menyediakan senyawa organik yang dibuat dengan fotosintesis untuk bakteri. [ 2 ] Hubungan yang saling menguntungkan ini terjadi pada semua rhizobia , di mana genus Rhizobium adalah contoh yang khas.
Sejarah
Martinus Beijerinck adalah yang pertama kali mengisolasi dan menumbuhkan mikroorganisme dari nodul kacang-kacangan pada tahun 1888. Ia menamakannya Bacillus radicicola , yang sekarang ditempatkan dalam di bawah genus Rhizobium .
Penelitian
Rhizobium membentuk hubungan simbiosis dengan tanaman tertentu seperti kacang-kacangan, memfiksasi nitrogen dari udara menjadi amonia, yang bertindak sebagai pupuk alami untuk tanaman. Penelitian saat ini sedang dilakukan oleh ahli mikrobiologi dari untuk menemukan cara untuk memanfaatkan fiksasi nitrogen Rhizobium . Penelitian ini melibatkan pemetaan genetik dari berbagai spesies rhizobia dengan spesies tanaman simbiotik masing-masing, seperti alfalfa atau kedelai. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanpa menggunakan pupuk. [ 3 ]
Dalam biologi molekuler, Rhizobium juga telah diidentifikasi sebagai pencemar dari kit pereaksi ekstraksi DNA dan sistem air ultra murni, sehingga Rhizobium dapat muncul secara keliru di kumpulan data mikrobiota atau metagenom. [ 4 ] Kehadiran bakteri pengikat nitrogen sebagai kontaminan mungkin karena penggunaan gas nitrogen dalam produksi air ultra-murni untuk menghambat pertumbuhan mikrob dalam tangki penyimpanan. [ 5 ]
Spesies
- Shamseldin et al . 2016
- (Hirsch and Müller 1986) Kaur et al . 2011 [ 6 ]
- Berge et al . 2009
- Baraúna et al . 2016
- Sheu et al . 2015
- Zhang et al . 2015
- Mnasri et al . 2014
- Behrendt et al . 2016
-
Harun-or Rashid
et al
. 2015
- symbiovar trifolii
- symbiovar viciae
- Harun-or Rashid et al . 2015
- Rincón-Rosales et al . 2013
- Lin et al . 2015
- Liu et al . 2015
- García-Fraile et al . 2007
- Quan et al . 2005
- Ribeiro et al . 2015
- Parag et al . 2014
- López-López et al . 2010
-
Segovia
et al
. 1993
[
7
]
- symbiovar mimosae
- symbiovar phaseoli
- Tian et al . 2008
- Gu et al . 2014
- Dall'Agnol et all . 2013
- Amarger et al . 1997
- López-López et al . 2011
- Chen et al . 1997
- Bibi et al . 2012
- Diange and Lee 2013 [ 10 ]
- Wei et al . 2002
- Rincón-Rosales et al . 2013
- Shen et al . 2010
- Saïdi et al . 2014
-
(Frank 1879) Frank 1889
- symbiovar trifolii
- symbiovar viciae
- Kittiwongwattana & Thawai 2014
- Harun-or Rashid et al . 2015
- Ribeiro et al . 2011
- Wei et al . 2003
- Valverde et al . 2006
- Greub et al . 2004.
- Rincón-Rosales et al . 2013
- López-López et al . 2011
- Lin et al . 2009
- Grison et al . 2015
- Gu et al . 2008
- Herr Baronn O. Vonn Berkum et al . 1998 [ 9 ]
- Han et al . 2008
- Kaiya et al . 2012
- Zhang et al . 2015
- Khalid et al . 2014
- Dall'Agnol et al . 2014
- Zhang et al . 2012
- Dangeard 1926 emend. Ramírez-Bahena et al . 2008
- Wen et al . 2011
- Ramírez-Bahena et al . 2008
- Kesari et al . 2013 [ 12 ]
- Rozahon et al . 2014
- Xu et al . 2013 [ 13 ]
- (Riker et al . 1930) Young et al . 2001
- Zhang et al . 2014
- Kaur et al . 2011
- corrig. Hunter et al . 2008
- Zhang et al . 2014
- Yoon et al . 2010
- Jiao et al . 2014
- Jiao et al . 2014
- Lin et al . 2014
- Ramana et al . 2013
- Squartini et al . 2002
- Turdahon et al . 2012 [ 14 ]
- Hou et al . 2009
- Martínez-Romero et al . 1991
- Zhang et al . 2011
- Wang et all . 2011 [ 15 ]
- Tan et al . 2001 [ 9 ]
- Chen et al . 2015
Filogeni
Taksonomi yang diterima saat ini berdasarkan (LPSN) [ 1 ] dan National Center for Biotechnology Information (NCBI) [ 16 ] dan filogeninya berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh . [ 17 ]
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Referensi
- ^ a b J.P. Euzéby. " Rhizobium " . (LPSN). Diarsipkan dari asli tanggal 2012-05-23 . Diakses tanggal 2012-05-02 .
- ^ Sawada H, Kuykendall LD, Young JM (2003). "Changing concepts in the systematics of bacterial nitrogen-fixing legume symbionts". J. Gen. Appl. Microbiol . 49 (3): 155– 79. doi : 10.2323/jgam.49.155 . PMID 12949698 .
- ^ "Marvelous Microbe Collections Accelerate Discoveries To Protect People, Plants—and More!" . Agricultural Research . United States Department of Agriculture. January 2010 . Diakses tanggal 10 August 2018 .
- ^
- ^ Kulakov, L; McAlister, M; Ogden, K; Larkin, M; O'Hanlon, J (2002). "Analysis of Bacteria Contaminating Ultrapure Water in Industrial Systems" . Applied and Environmental Microbiology . 68 : 1548– 1555. doi : 10.1128/AEM.68.4.1548-1555.2002 . PMC 123900 . PMID 11916667 .
- ^ NOTE: This strain was formerly named Blastobacter aggregatus .
- ^ NOTE: This species was formerly known as R. leguminosarum sv. phaseoli .
- ^ a b Amarger N, Macheret V, Laguerre G (1997). " Rhizobium gallicum sp. nov. and Rhizobium giardinii sp. nov., from Phaseolus vulgaris nodules". Int. J. Syst. Bacteriol . 47 (4): 996– 1006. doi : 10.1099/00207713-47-4-996 . PMID 9336898 .
- ^ a b c NOTE: R. gallicum and R. mongolense are 99.2% identical in their rDNA and may be the same species. It has been proposed by Silva et al . that R. mongolense and R. yanglingense be reclassified as R. gallicum sv. orientale .
- ^ Diange, E. A.; Lee, S. S. (2013). " Rhizobium halotolerans sp. nov., Isolated from Chloroethylenes Contaminated Soil". Current Microbiology . 66 (6): 599– 605. doi : 10.1007/s00284-013-0313-x . PMID 23377488 .
- ^ a b Marek-Kozaczuk M, Leszcz A, Wielbo J, Wdowiak-Wróbel S, Skorupska A (2013). " Rhizobium pisi sv. trifolii K3.22 harboring nod genes of the Rhizobium leguminosarum sv. trifolii cluster". Syst. Appl. Microbiol . 36 (4): 252– 8. doi : 10.1016/j.syapm.2013.01.005 . PMID 23507586 .
- ^ Kesari, V.; Ramesh, A. M.; Rangan, L. (2013). " Rhizobium pongamiae sp. nov. From Root Nodules of Pongamia pinnata". BioMed Research International . 2013 : 1– 9. doi : 10.1155/2013/165198 . Pemeliharaan CS1: DOI bebas tanpa ditandai ( link )
- ^ Xu, Lin; Zhang, Yong; Deng, Zheng Shan; Zhao, Liang; Wei, Xiu Li; Wei, Ge Hong (2013). " Rhizobium qilianshanense sp. nov., a novel species isolated from root nodule of * Oxytropis ochrocephala Bunge in China". Antonie van Leeuwenhoek . 103 (3): 559– 565. doi : 10.1007/s10482-012-9840-x .
- ^ Turdahon M, Osman G, Hamdun M, Yusuf K, Abdurehim Z, Abaydulla G, Abdukerim M, Fang C, Rahman E (2012). " Rhizobium tarimense sp. nov. isolated from soil in the ancient Khiyik river of Xinjiang, China". Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 63 (Pt 7): 2424– 9. doi : 10.1099/ijs.0.042176-0 . PMID 23203621 .
- ^ Fang Wang; En Tao Wang; Li Juan Wu; Xin Hua Sui; Ying Li Jr.; Wen Xin Chen (2011). " Rhizobium vallis sp. nov., isolated from nodules of three leguminous species". Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 61 (11): 2582– 2588. doi : 10.1099/ijs.0.026484-0 . PMID 21131504 .
- ^ Sayers; et al. " Rhizobium / Agrobacterium group" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database . Diakses tanggal 2012-05-02 .
- ^ . "16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF) . . Diarsipkan dari asli (PDF) tanggal 2012-05-07 . Diakses tanggal 2012-05-02 .
- ^ This is the type species for the genus.
- ^ Arthrobacter viscosus sekarang diklasifikasikan dalam . Lihat .
Pranala luar
- Current research on Rhizobium leguminosarum at the
- Video and commentary on root nodules and Rhizobium in White Clover
| Perpustakaan nasional | |
|---|---|
| Lain-lain | |
