Nukleoprotein adalah protein yang strukturnya terikat dengan asam nukleat, [ 1 ] baik DNA maupun RNA . Jenis-jenis nukleoprotein yaitu ribosom , nukleosom , dan protein nukleokapsid dari virus.
Contoh
Deoksiribonukleoprotein
(DNP) adalah kompleks DNA dan protein . Contoh prototipikalnya adalah nukleosom , kompleks dengan DNA membungkus kelompok dari delapan protein histon di dalam sel eukariotik untuk membentuk kromatin . Protamin menggantikan histon saat spermatogenesis.
Ribonukleoprotein
(RNP) adalah kompleks RNA dan protein. Enzim telomerase , , dan (snRNPs), serta ribosom adalah ribonukleoprotein. Ribosom terdiri atas satu molekul dari 50 protein ribosom atau lebih bersama dengan tiga macam molekul RNA dalam prokariota atau empat macam dalam eukariota .
Beberapa virus hanya memiliki ribonukleoprotein sederhana, mengandung satu molekul RNA dan beberapa molekul protein yang identik. Virus-virus lain memiliki ribonukleoprotein atau deoksiribonukleoprotein kompleks yang mengandung sejumlah protein yang berbeda dan mempunyai jumlah molekul asam ribonuklet yang banyak.
Fungsi
Dalam sel eukariotik , DNA dikaitkan dengan sejumlah massa protein histon yang sama di dalam kompleks nukleoprotein yang padat bernama kromatin . [ 2 ] Deoksiribonukleoprotein dalam kompleks ini berinteraksi untuk membuat kompleks multiprotein dengan DNA yang bersangkut membuat struktur lengkung atau pilin. Deoksiribonukleoprotein berpartisipasi dalam pengaturan replikasi dan transkripsi DNA. [ 3 ]
Ribonukleoprotein mempunyai peran proteksi. Di dalam sel, mRNA tidak akan pernah ditemukan sebagai molekul bebas. RNA selalu berkaitan dengan ribonukleoprotein dan berfungsi sebagai kompleks ribonukleoprotein. [ 2 ]
Dengan cara yang sama, genom RNA virus dengan untai negatif tidak akan pernah ditemukan sebagai molekul RNA yang bebas. Ribonukleoprotein melindungi genom dari . [ 4 ] Nukleoprotein sering merupakan antigen utama untuk virus karena mereka mempunyai determinan antigenik spesifik.
Struktur
Melalui metode kristalografi, spesifikasi struktur ruang dan fungsi biologis dari nukleoprotein dapat dipahami. [ 5 ] [ 6 ] Banyak struktur nukleoprotein virus telah ditemukan, termasuk struktur virus , [ 7 ] rabies , [ 8 ] Ebola , , [ 9 ] , [ 9 ] , [ 10 ] , [ 11 ] dan . [ 12 ] Teknik penting untuk mendeteksi struktur nukleoprotein yaitu difraksi sinar-x , resonansi magnet inti dan .
Lihat juga
Referensi
- ^ MeSH Nucleoproteins
- ^ a b Lodish, Harvey (2000). Molecular Cell Biology .
- ^ Echols, Harrison (1990). "Nucleoprotein structures initiating DNA replication, transcription, and site-specific recombination". The Journal of Biological Chemistry . 265 : 14697– 700. PMID 2203758 .
- ^ Ruigrok, Rob WH; Crépin, Thibaut; Kolakofsky, Dan. "Nucleoproteins and nucleocapsids of negative-strand RNA viruses" . Current Opinion in Microbiology . 14 (4): 504– 510. doi : 10.1016/j.mib.2011.07.011 .
- ^ Graeme K. Hunter G. K. (2000): Vital Forces. The discovery of the molecular basis of life. Academic Press, London 2000, ISBN 0-12-361811-8 .
- ^ Nelson D. L., Cox M. M. (2013): Lehninger Biochemie. Springer, ISBN 978-3-540-68637-8 .
- ^ Ng, Andy Ka-Leung; Wang, Jia-Huai; Shaw, Pang-Chui (2009-05-27). "Structure and sequence analysis of influenza A virus nucleoprotein" . Science in China Series C: Life Sciences (dalam bahasa Inggris). 52 (5): 439– 449. doi : 10.1007/s11427-009-0064-x . ISSN 1006-9305 .
- ^ Albertini, Aurélie A. V.; Wernimont, Amy K.; Muziol, Tadeusz; Ravelli, Raimond B. G.; Clapier, Cedric R.; Schoehn, Guy; Weissenhorn, Winfried; Ruigrok, Rob W. H. (2006-07-21). "Crystal Structure of the Rabies Virus Nucleoprotein-RNA Complex" . Science (dalam bahasa Inggris). 313 (5785): 360– 363. doi : 10.1126/science.1125280 . ISSN 0036-8075 . PMID 16778023 .
- ^ a b Ariza, A.; Tanner, S. J.; Walter, C. T.; Dent, K. C.; Shepherd, D. A.; Wu, W.; Matthews, S. V.; Hiscox, J. A.; Green, T. J. (2013-06-01). "Nucleocapsid protein structures from orthobunyaviruses reveal insight into ribonucleoprotein architecture and RNA polymerization" . Nucleic Acids Research . 41 (11): 5912– 5926. doi : 10.1093/nar/gkt268 . ISSN 0305-1048 . PMC 3675483 . PMID 23595147 .
- ^ Surtees, Rebecca; Ariza, Antonio; Punch, Emma K.; Trinh, Chi H.; Dowall, Stuart D.; Hewson, Roger; Hiscox, Julian A.; Barr, John N.; Edwards, Thomas A. (2015-01-01). "The crystal structure of the Hazara virus nucleocapsid protein" . BMC Structural Biology . 15 : 24. doi : 10.1186/s12900-015-0051-3 . ISSN 1472-6807 . PMC 4696240 . PMID 26715309 . Pemeliharaan CS1: DOI bebas tanpa ditandai ( link )
- ^ Carter, Stephen D.; Surtees, Rebecca; Walter, Cheryl T.; Ariza, Antonio; Bergeron, Éric; Nichol, Stuart T.; Hiscox, Julian A.; Edwards, Thomas A.; Barr, John N. (2012-10-15). "Structure, Function, and Evolution of the Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus Nucleocapsid Protein" . Journal of Virology (dalam bahasa Inggris). 86 (20): 10914– 10923. doi : 10.1128/JVI.01555-12 . ISSN 0022-538X . PMC 3457148 . PMID 22875964 . Diarsipkan dari asli tanggal 2017-09-10 . Diakses tanggal 2017-12-30 .
- ^ Qi, Xiaoxuan; Lan, Shuiyun; Wang, Wenjian; Schelde, Lisa McLay; Dong, Haohao; Wallat, Gregor D.; Ly, Hinh; Liang, Yuying; Dong, Changjiang. "Cap binding and immune evasion revealed by Lassa nucleoprotein structure" . Nature . 468 (7325): 779– 783. doi : 10.1038/nature09605 . PMC 3057469 . PMID 21085117 .