|
Artikel atau sebagian dari artikel ini mungkin diterjemahkan dari
Epsilonproteobacteria
di en.wikipedia.org.
Isinya masih belum akurat
, karena bagian yang diterjemahkan masih perlu diperhalus dan disempurnakan. Jika Anda menguasai bahasa aslinya, harap pertimbangkan untuk menelusuri referensinya dan menyempurnakan terjemahan ini. Anda juga dapat ikut bergotong royong pada
ProyekWiki Perbaikan Terjemahan
.
(Pesan ini dapat dihapus jika terjemahan dirasa sudah cukup tepat. Lihat pula: panduan penerjemahan artikel ) |
| Epsilonproteobacteria | |
|---|---|
|
|
| Campylobacter | |
| Klasifikasi ilmiah | |
| Domain: | |
| Filum: | |
| Kelas: |
Epsilonproteobacteria
|
| Ordo | |
Epsilonproteobacteria adalah kelas Proteobacteria . [ 1 ] Semua spesies dalam kelas ini adalah, seperti semua Proteobacteria, Gram-negatif .
Epsilonproteobacteria terdiri dari beberapa genera yang diketahui, terutama spp. melengkung hingga spirilloid, Helicobacter spp., dan Campylobacter spp. Sebagian besar spesies yang dikenal menghuni saluran pencernaan hewan dan berfungsi sebagai simbion ( Wolinella spp. di sapi ) atau patogen ( Helicobacter spp. di lambung, Campylobacter spp. di duodenum).
Banyak sekuens lingkungan dan isolat Epsilonproteobacteria juga telah didapatkan dari ventilasi hidrotermal dan habitat rembesan dingin . Contoh isolat termasuk autotrophica , [ 2 ] paralvinellae , [ 3 ] lithotrophicum [ 4 ] dan . [ 5 ] Sebuah anggota kelas Epsilonproteobacteria hidup sebagai endosimbion pada insang besar dari siput laut dalam . [ 6 ]
Epsilonproteobacteria yang ditemukan di ventilasi hidrotermal laut-dalam secara khas menunjukkan kemolitotrofi, memenuhi kebutuhan energi mereka dengan mengoksidasi sulfur tereduksi, format, atau hidrogen ditambah dengan reduksi nitrat atau oksigen. [ 7 ] Epsilonproteobacteria autotrof menggunakan siklus Krebs terbalik untuk memfiksasi karbon dioksida ke biomassa, jalur yang awalnya dianggap kurang penting di lingkungan. Sensitivitas oksigen dari jalur ini konsisten dengan relung mikroaerofilik atau anaerobik dalam lingkungan ini, dan kemungkinan evolusi mereka di lautan Mesoproterozoikum , [ 8 ] yang dianggap mengandung sulfida dengan rendahnya tingkat oksigen yang tersedia dari fotosintesis sianobakteri. [ 9 ]
Filogeni
Taksonomi yang diterima saat ini berdasarkan (LPSN) [ 10 ] dan National Center for Biotechnology Information (NCBI) [ 11 ] dan filogeni berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh [ 12 ]
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Catatan:
- Prokariota tanpa kultur murni ( ) yang diisolasi atau tersedia, yaitu tidak dibiakkan atau tidak dapat ditopang dalam kultur untuk lebih dari beberapa serial passage
Referensi
- ^ "www.ncbi.nlm.nih.gov" . Diakses tanggal 2009-03-19 .
- ^ Inagaki, F. (2003-11-01). "Sulfurimonas autotrophica gen. nov., sp. nov., a novel sulfur-oxidizing -proteobacterium isolated from hydrothermal sediments in the Mid-Okinawa Trough" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 53 (6): 1801–1805. doi : 10.1099/ijs.0.02682-0 . ISSN 1466-5026 . Diakses tanggal 2013-05-29 . [ pranala nonaktif permanen ]
- ^ Takai, K. (2006-08-01). "Sulfurimonas paralvinellae sp. nov., a novel mesophilic, hydrogen- and sulfur-oxidizing chemolithoautotroph within the Epsilonproteobacteria isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete nest, reclassification of Thiomicrospira denitrificans as Sulfurimonas denitrificans comb. nov. and emended description of the genus Sulfurimonas" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 56 (8): 1725–1733. doi : 10.1099/ijs.0.64255-0 . ISSN 1466-5026 . Diakses tanggal 2012-11-09 . [ pranala nonaktif permanen ]
- ^ Inagaki, Fumio; Ken Takai; Kenneth H. Nealson; Koki Horikoshi (2004-09-01). "Sulfurovum lithotrophicum gen. nov., sp. nov., a novel sulfur-oxidizing chemolithoautotroph within the ε-Proteobacteria isolated from Okinawa Trough hydrothermal sediments" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 54 (5): 1477–1482. doi : 10.1099/ijs.0.03042-0 . ISSN 1466-5026 . Diarsipkan dari versi asli tanggal 2013-07-08 . Diakses tanggal 2013-06-27 .
- ^ Julie L. Smith, Barbara J. Campbell, Thomas E. Hanson, Chuanlun L. Zhang & S. Craig Cary (2008). " Nautilia profundicola sp. nov., a thermophilic, sulfur-reducing epsilonproteobacterium from deep-sea hydrothermal vents". . 58 (7): 1598–1602. doi : 10.1099/ijs.0.65435-0 . PMID 18599701 .
- ^ Suzuki, Yohey; Sasaki, Takenori; Suzuki, Masae; Nogi, Yuichi; Miwa, Tetsuya; Takai, Ken; Nealson, Kenneth H.; Horikoshi, Koki (2005). "Novel Chemoautotrophic Endosymbiosis between a Member of the Epsilonproteobacteria and the Hydrothermal-Vent Gastropod Alviniconcha aff. hessleri ( Gastropoda : Provannidae ) from the Indian Ocean". . 71 (9): 5440–5450. doi : 10.1128/AEM.71.9.5440-5450.2005 .
- ^ Takai, Ken; et al. (2005). "Enzymatic and genetic characterization of carbon and energy metabolisms by deep-sea hydrothermal chemolithoautotrophic isolates of Epsilonproteobacteria " (PDF) . Applied and Environmental Microbiology . 71 (11): 7310–7320. doi : 10.1128/aem.71.11.7310-7320.2005 . [ pranala nonaktif permanen ]
- ^ Campbell, Barbara J.; Annette Summers Engel; Megan L. Porter; Ken Takai (2006-05-02). "The versatile ε-proteobacteria: key players in sulphidic habitats" . Nature Reviews Microbiology . 4 (6): 458–468. doi : 10.1038/nrmicro1414 . ISSN 1740-1526 . Diakses tanggal 2012-11-09 .
- ^ Anbar, A. D.; A. H. Knoll (2002-08-16). "Proterozoic Ocean Chemistry and Evolution: A Bioinorganic Bridge?" . Science . 297 (5584): 1137–1142. doi : 10.1126/science.1069651 . Diakses tanggal 2010-10-12 .
- ^ J.P. Euzéby. "Epsilonproteobacteria" . (LPSN). Diarsipkan dari versi asli tanggal 2013-01-27 . Diakses tanggal 2011-11-17 .
- ^ Sayers; et al. "Epsilonproteobacteria" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database . Diakses tanggal 2011-06-05 .
- ^ . "16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF) . . Diarsipkan dari versi asli (PDF) tanggal 2012-05-07 . Diakses tanggal 2011-11-17 .
Pranala luar